发布时间:2021-12-23 17:21 原文链接:

  靶向肿瘤特异性t细胞的癌症免疫疗法已使许多癌症患者受益,但是针对不同类型的癌症的临床疗效差异很大。肿瘤浸润t细胞经常进入功能失调状态,这一现象被广泛称为t细胞衰竭(t cell exhaustion),而效应t细胞的抗肿瘤功能受多种因素调节,包括调节性t细胞(treg细胞)的存在。t细胞的状态和丰度在不同癌症类型的肿瘤微环境(tme)中有所不同,这可能从根本上影响不同的临床参数,如对免疫疗法的药物反应。

  在一项新的研究中,为了建立一种高分辨率的泛癌t细胞图谱,来自中国北京大学的研究人员对各种癌症类型的患者的肿瘤、癌旁组织和血液样本进行了单细胞rna测序(scrna-seq),并收集了其他已发表的scrna-seq数据集。在校正了混杂因素和批次效应后,对这些不同的数据进行了整合。该图谱由21种癌症类型的316名患者的scrna-seq数据组成。将t细胞表面上的t细胞受体(tcr)序列与基因表达谱组合起来,以描述t细胞的扩增和动态。应用各种计算方法来研究不同癌症类型的t细胞的特征和丰度。相关研究结果发表在2021年12月17日的science期刊上,论文标题为“pan-cancer single-cell landscape of tumor-infiltrating t cells”。

  这些作者在癌症患者中发现了多种潜在的肿瘤反应性t细胞(ptrt)群体。在不同类型的癌症的肿瘤微环境中,ptrt的状态有很大的不同。对于cd8 t细胞而言,主要的ptrt是功能衰竭的t细胞,并表现出高度的异质性。他们通过计算推断出t细胞衰竭的两条主要发展路径,分别是通过效应记忆t细胞和组织驻留记忆t细胞,而且这两条路径在不同的癌症类型中都很普遍。他们还注意到末端衰竭的t细胞与自然杀伤(nk)样t细胞、17型cd8 t细胞(tc17细胞)细胞和cd8 treg细胞等细胞之间的状态转换,但这类转换往往发生在特定的癌症类型中。

  对于cd4 t细胞而言,tfh/th1双功能t细胞似乎起源于tfh细胞,也是值得注意的ptrt,并与肿瘤突变负荷相关联。他们还发现,ptrt的转录程序可以受到肿瘤微环境中tgf-β和干扰素的影响。t细胞状态的丰度因癌症类型的不同而有很大的差异。基于肿瘤浸润t细胞的组成,癌症患者可以被免疫分型为一组具有高频率的终末衰竭cd8 t细胞和另一组具有高频率的组织驻留记忆cd8 t细胞,并且免疫类型与临床特征相关,如患者的生存率和对免疫检查点阻断的反应。

  综上所述,这些作者描绘了肿瘤微环境中t细胞异质性和动态的泛癌景观,并为未来与癌症治疗相关的时间或空间研究建立了一个基线参考。对不同癌症类型的系统比较揭示了不同肿瘤微环境中t细胞状态的共性和差异。他们对肿瘤浸润t细胞的详细特征、动态和调控的揭示将促进免疫疗法的开发,而且他们提出的免疫分型可以有助于靶向t细胞的治疗和诊断策略。

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